Tras un sorteo realizado en la sede de CONMEBOL en Paraguay se definieron los grupos de la Copa Libertadores con el que se jugará este torneo en el 2016.
Por Ecuador, los representantes serán Emelec y Liga de Quito directamente para la Fase de Grupos, mientras que Independiente del Valle clasificó al repechaje.
El rival de Independiente del Valle en la fase previa será Guaraní, comenzando la serie en condición de local y definiendo en tierras paraguayas, teniendo la posibilidad de clasificar al Grupo 5 de pasar esta etapa.
La fase previa
G1: Oriente Petrolero Vs. Independiente Santa Fe
G2: Huracán Vs. Caracas
G3: Puebla Vs. Racing
G4: River Plate (U) Vs. U. de Chile
G5: Independiente del Valle Vs. Guaraní
G6: César Vallejo Vs. Sao Paulo
Los grupos de la Copa Libertadores:
Grupo 1
River Plate
The Strongest
Trujillanos
G6
Grupo 2
Nacional
Palmeiras
Rosario Central
G4
Grupo 3
Boca Juniors
Bolívar
Deportivo Cali
G3
Grupo 4
Peñarol
Atlético Nacional
Sporting Cristal
G2
Grupo 5
Atlético Mineiro
Colo Colo
Melgar
G5
Grupo 6
San Lorenzo
Gremio
Liga de Quito
Toluca
Grupo 7
Olimpia
Emelec
Deportivo Táchira
Pumas
Grupo 8
Corinthians
Cerro Porteño
Cobresal
G1